刺客信条两大阵营的起源其实在前作里面已经表露得比较清楚了，只是游戏没有平铺直叙的表明出来。可以肯定的是先有圣殿骑士，然后有的刺客集团。而且刺客阵营分为前后两个时期。
一、 先说两个正营的起源
1. 圣殿骑士的起源
首先是圣殿骑士。圣殿骑士的起源至今没有说明，但是他们的目的是明显的，追求知识，真理和Power，强调理性，其目的是建立新秩序。其追求有点类似于哲学家，但是追求的方式不同：哲学家是靠自己的思索探求真理，而圣殿骑士是追求先人留下来的文明探索真理；其具体表现就在于寻求古代文明留下来的神器。
2. 刺客阵营的起源
1） Mualim的兄弟会
这里就有了刺客阵营的前身，以AltaÏr的师父Mualim为首的刺客阵营。根据一代剧情，Mualim本来也就是一个圣殿骑士中的一员，由于想独自贪图神器与圣殿骑士决裂，自己成立刺客阵营，依靠AltaÏr和其他弟子杀死其他圣殿骑士，独吞神器，获得控制他人的力量。（当然AltaÏr和其他弟子之前都不知道真相，只是以为那些圣殿骑士奴役人民，其实那些圣殿骑士是在建立所谓的新秩序。这个剧情很有笑傲江湖岳不群和令狐冲那个味道，放荡不羁的大弟子和老谋深算的师父。）
AltaÏr在铲除了Mualim，封印了神器,（其实是藏匿，就是在启示录里面Ezio在AltaÏr的图书馆里面找到的东西）之后才建立了我们平常说的刺客阵营（其实刺客集团内部称自己是兄弟会，外面的人才称他们是刺客）。
为什么我说Mualim建立的兄弟会和AltaÏr建立的兄弟会是两个不同性质的兄弟会？我们看看前后两个兄弟会的教条就知道了。
在刺客信条1中，AltaÏr因为触犯了的兄弟会的三个基本教条，而被其师父杀过一次。（后来又被师父复活了……）我们来看看这三个基本教条。（由于硬盘里面没有游戏了，我就看Youku视频听译，渣翻了）
Three simple tenets
First and foremost, stayyour blade from the flesh of innocent
The second tenet is whatgive us strength, Hide in clean site, let the people mask you so that youbecome one of the crowd
Last one never compromisethe brotherhood
三个基本教条
首先，刀剑不染无辜者之血
第二个教条给予我们力量。世人皆吾蔽，大隐隐于世，
最后一条，永不背叛兄弟会。
由此可以看出，Mualim建立的兄弟会有很大的圣殿骑士思想的残余，其秩序性很强。就是在教训AltaÏr的时候也让他丫闭嘴（stay your tongue）
2） AltaÏr以及以后的兄弟会
我们在反过来看看AltaÏr以及后来Ezio重建的兄弟会，其教条保留了AltaÏr在Mualim的兄弟会中最喜欢的教条。这个教条其实是Mualim兄弟会中的最后一条，很有可能就是Mualim本来你想要在拿到神器后，服众要利用的教条（其实后来发现根本用不着了）。这一段教条就是著名的：
When other men blindlyfollow the truth,remember...Nothing is true.
When other men are limited,by morality or law,remember...Everything ispermitted.
We work in the dark to serve the light.We are assassins.
Nothing is true,everything is permitted.
当其他人盲目追寻真实的时候，记住，万物皆虚……
当其他人被道德和法律束缚住的时候，记住，万事皆允……
我们行于黑暗，只为服务于光明，我们是刺客……
万物皆虚，万事皆允
可以看出，与之前的兄弟会相反，AltaÏr的兄弟会反对秩序和规则，而是一种寻求自由的信仰。信仰之跃本来在Mualim是训练信念的产物，后来就变成信仰自由的仪式。相信在游戏中的高塔上跳下与鹰同翔的瞬间，每个人都会感到一种超脱，那就是一种自由。
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二、再说两个阵营对立的矛盾及其含义
前面已经说了很多了，相信大家已经感受到两个阵营在什么地方对立。没错，就是自由与秩序的对立。而这种意识的对立很难说出对错之分，一个典型的例子就可以在一代中得以体现。
圣殿骑士Jubair Al Hakim是一个大马士革中场阶级区的一个激进派的大学士，有骑士般的勇气和意志，以及学者般儒雅的风度，他试图烧毁所有的书籍，因为他认为这些封建残留的书毒害了人民的思想，约束控制了他们的思维，令他们不敢怀疑猜想，难以取得更大的进步。他的想法似乎是对的，当年俄罗斯的彼得大帝也是这么做的，当然最后彼得大帝成为一代伟人，而我们的Jubair却被杀害了。而Altair的观点是人民有信仰自由，让社会进步的根本目的是帮助人民更快乐的生活，如果社会进步让人民生活不快乐的话，那就违背了社会进步的初衷，那就应该放弃进步。
前面我们提到了刺客阵营的基本信条是万物皆虚，万事皆允，我们再来看看刺客信条4中，最新给出的圣殿骑士的教条。
Mark and remember our purposes:
To guide all wayward souls til they reach a quietroad；
To guide all wayward desire til impassioned heartsare cooled.；
To guide all wayward minds to safe and sober thought；
By the Father ofUnderstandings Light, (may the father of understanding guide us)
Let our work now begin.
谨记我们的目标
引领所有躁动的灵魂，直到走上宁静之道；
引领所有鼓动的欲望，直到激昂的热血冷却；
引领所有浮动的意志，以至化为安稳的沉思；
以洞察之父为名，（愿洞察之父指吾辈——这是三代查尔斯·李被封为圣殿骑士时的说法）
让我们开始工作吧。
可以看出圣殿骑士不是很多人以为的那种“坏人”，他们有自己的信念，做事有自己的一套的风格，就像刺客有暗杀的风格一样。从政治角度上看，圣殿骑士是政治家，当权者，追寻的是秩序，安定和稳定的知识，可知论者，不惜欺骗迷惑甚至奴役大众。而刺客则是反抗的起义者，追求的是自由和独立，他们是不可知论者，相信一切的可能性。从刺客信条三开始，我们发现《刺客信条》作品开始切入圣殿骑士的视角，描述他们所看到的真相。而在玩前两部时我们更多的是一头雾水，体现了他们阵营中的可能性。
这就是刺客信条，一个自由度极高，耐玩度极强，包含各种文化历史乃至哲学内涵以及各种游戏类型的“体验”。它不仅是一款游戏，而是一种体验，一种Animus的体验。
有一点却是忽略了，似乎很致命。刺客确实是很早就存在了，不过有数次的消亡和复兴。Mualim很有可能就是一个重兴刺客阵营的人。可以说“兄弟会”这种东西，以及其信条很有可能就是他创立的。这也符合圣殿骑士善于利用一些东西利用他人的特点。
关于Jubair Al Hakim，确实是我从百度百科截过来的，原因是我觉得这是一个很好的例子。Jubair Al Hakim焚烧书籍就是一种建立新秩序的一种手段。刺客信条1 有些细节确实有点忘记了，毕竟时间有点长
